Die Pilatus Praxis ist eine unabhängige hausärztliche Gruppenpraxis. Als Aktiengesellschaft wird die Praxis von den vier Praxisinhabern geführt. Eine klare Ressortaufteilung gewährleistet eine schlanke Führungsstruktur und kurze Entscheidungswege. Die Verantwortlichkeiten sind aufgeteilt in die Ressorts Praxisorganisation, Finanzen, Personal und Lehrlinge.